事发之后，东皇帝国军情总局反谍部门会同帝国警务部的顶尖刑侦专家组成了调查组。他们对于整个昊天殿学内部人员全部排查了一遍。根据凌锐指证的作案目标实际应该是云瑶，所以在内部排查的时候，着重点就落在了罪犯的动机上。

调查组的排查，最终将罪犯锁定在了三个人的小范围中。这三人分别是机械分部的一个助理研究员，他妻子的一个亲戚和云家有业务纠纷。另一个是化学分部的研究员，他前妻红杏出墙，两人离婚后他前妻嫁给了云瑶的表哥。而第三个人是传承分部的一个作为实验受体的十五岁的大男孩。他是梁迪的儿子。